Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 DCD1YHR144C 939 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 YKL071WYKL071W 771 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 SPC3YLR066W 555 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 YMR245WYMR245W 621 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 INA17YPL099C 549 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 APC4YDR118W 1959 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 BCH2YKR027W 2298 nt4.98□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 MSC2YDR205W 2175 nt4.97□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 HOM3YER052C 1584 nt4.97□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 BUD22YMR014W 1560 nt4.97□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 YDR417CYDR417C 372 nt4.97□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 RNA1YMR235C 1224 nt4.97□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 LYP1YNL268W 1836 nt4.97□□□□□ -1.61
RTP1Q12751 YBL077WYBL077W 432 nt4.96□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 SLZ1YNL196C 897 nt4.96□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 ATG8YBL078C 354 nt4.96□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 FOX2YKR009C 2703 nt4.96□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 BUD30YDL151C 582 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 PHO13YDL236W 939 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YFT2YDR319C 825 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 SPC24YMR117C 642 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 PUF2YPR042C 3228 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 GIP4YAL031C 2283 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 IDS2YJL146W 1410 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 PAF1YBR279W 1338 nt4.95□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 MDR1YGR100W 2853 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 BOP2YLR267W 1713 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 CBF5YLR175W 1452 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 NAM9YNL137C 1461 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 GSY1YFR015C 2127 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 PRP19YLL036C 1512 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 MRM2YGL136C 963 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YHB1YGR234W 1200 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 TTI2YJR136C 1266 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YKL023WYKL023W 834 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 TLG2YOL018C 1194 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 SAT4YCR008W 1812 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 KAP114YGL241W 3015 nt4.94□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 MDM30YLR368W 1797 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 ADP1YCR011C 3150 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YDR282CYDR282C 1245 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 UBC8YEL012W 657 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YEL067CYEL067C 588 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 MPS3YJL019W 2049 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 KAR2YJL034W 2049 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 CTR1YPR124W 1221 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 SYF1YDR416W 2580 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 OPT2YPR194C 2634 nt4.93□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 CTT1YGR088W 1689 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 UGA3YDL170W 1587 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 CDA2YLR308W 939 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 TDA5YLR426W 981 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 CPR3YML078W 549 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 DSC2YOL073C 969 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 RAD17YOR368W 1206 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 snR37snR37 386 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 TUB3YML124C 1338 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 PDR5YOR153W 4536 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 GCN20YFR009W 2259 nt4.92□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 TYR1YBR166C 1359 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YEL045CYEL045C 426 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 CPR6YLR216C 1116 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YLR225CYLR225C 1224 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 TRS33YOR115C 807 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 VPS28YPL065W 729 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YCL012CYCL012C 405 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 RCM1YNL022C 1473 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 PHO87YCR037C 2772 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 YPK3YBR028C 1578 nt4.91□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 ALG6YOR002W 1635 nt4.9□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 SUP35YDR172W 2058 nt4.9□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 ALE1YOR175C 1860 nt4.9□□□□□ -1.62
RTP1Q12751 DCV1YFR012W 609 nt4.9□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YGL101WYGL101W 648 nt4.9□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MRP4YHL004W 1185 nt4.9□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SPO16YHR153C 597 nt4.9□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SHE3YBR130C 1278 nt4.9□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YMR196WYMR196W 3267 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 GAD1YMR250W 1758 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YGR153WYGR153W 654 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SFH5YJL145W 885 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MNN11YJL183W 1269 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MSA2YKR077W 1092 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YML119WYML119W 1074 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 NCE102YPR149W 522 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SPO1YNL012W 1896 nt4.89□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 RTK1YDL025C 1863 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 ALR2YFL050C 2577 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MED2YDL005C 1296 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SRB5YGR104C 924 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YIL165CYIL165C 360 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MMM1YLL006W 1281 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 ERD2YBL040C 660 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 WRS1YOL097C 1299 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 VPS21YOR089C 633 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 OM14YBR230C 405 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 NAM2YLR382C 2685 nt4.88□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 UBP10YNL186W 2379 nt4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms