Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 IDS2YJL146W 1410 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 BCK2YER167W 2556 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 TRK1YJL129C 3708 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YDL094CYDL094C 510 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 PHO13YDL236W 939 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 PAD1YDR538W 729 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YJL220WYJL220W 453 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 RCL1YOL010W 1104 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 STP22YCL008C 1158 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 RSC3YDR303C 2658 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 MTR10YOR160W 2919 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 SSH4YKL124W 1740 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YMR221CYMR221C 1515 nt3.38□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 MAL13YGR288W 1422 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 FAA1YOR317W 2103 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 SRS2YJL092W 3525 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YCR050CYCR050C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YDL012CYDL012C 324 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 RPP1AYDL081C 321 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YAE1YJR067C 426 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 snR37snR37 386 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 DHH1YDL160C 1521 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 NMD3YHR170W 1557 nt3.37□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 SOF1YLL011W 1470 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 STV1YMR054W 2673 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YFR045WYFR045W 930 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 MRP4YHL004W 1185 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 ECM34YHL043W 513 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 ECM15YBL001C 315 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 MGR2YPL098C 342 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 IDI1YPL117C 867 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 MET12YPL023C 1974 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YTM1YOR272W 1383 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 PHO12YHR215W 1404 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 PHO11YAR071W 1404 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 TDA6YPR157W 1404 nt3.36□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 UBP6YFR010W 1500 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 UGA3YDL170W 1587 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YGL088WYGL088W 366 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YLF2YHL014C 1218 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 CIA2YHR122W 696 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YIL171WYIL171W 330 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 ISY1YJR050W 708 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YNL143CYNL143C 393 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 FSH3YOR280C 801 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 DPH6YLR143W 2058 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 DEG1YFL001W 1329 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 FAS2YPL231W 5664 nt3.35□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 ATG32YIL146C 1590 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 COX4YGL187C 468 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 RTA1YGR213C 954 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 DBR1YKL149C 1218 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 SRP40YKR092C 1221 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 SHE1YBL031W 1017 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 YBL059WYBL059W 582 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 SIW14YNL032W 846 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 URE2YNL229C 1065 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 UTP23YOR004W 765 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 UBA3YPR066W 900 nt3.34□□□□□ -1.87
YPL162CQ12042 MNN4YKL201C 3537 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 SET4YJL105W 1683 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 ABP140YOR239W 1887 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 RPS13YDR064W 456 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 HSP31YDR533C 714 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 VMA22YHR060W 546 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 GVP36YIL041W 981 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 IES3YLR052W 753 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YLR156WYLR156W 345 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YLR159WYLR159W 345 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YLR161WYLR161W 345 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 SWC7YLR385C 399 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 ECM23YPL021W 564 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 OSH2YDL019C 3852 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 SYF1YDR416W 2580 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 FMP25YLR077W 1752 nt3.33□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 PTR3YFR029W 2037 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 ALR2YFL050C 2577 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 RXT3YDL076C 885 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 RPL24AYGL031C 468 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YGL262WYGL262W 528 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YLR122CYLR122C 378 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 IDP2YLR174W 1239 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 NMA1YLR328W 1206 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YMR130WYMR130W 909 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YPT53YNL093W 663 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 INA17YPL099C 549 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 ICY2YPL250C 411 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 TIF5YPR041W 1218 nt3.32□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 BOI2YER114C 3123 nt3.31□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 BCH2YKR027W 2298 nt3.31□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 MLH2YLR035C 2088 nt3.31□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.31□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YGL193CYGL193C 312 nt3.31□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 YGR079WYGR079W 1113 nt3.31□□□□□ -1.88
YPL162CQ12042 HIS6YIL020C 786 nt3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms