Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPSF1Q10570 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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