Protein–RNA interactions for Protein: Q09327

MGAT3, Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT3Q09327 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGAT3Q09327 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT3Q09327 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT3Q09327 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms