Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A11Q08AI6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A11Q08AI6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms