Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP3CAQ08209 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP3CAQ08209 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms