Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGM3Q08188 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGM3Q08188 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms