Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 TPP1YMR156C 717 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ATG16YMR159C 453 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YBL094CYBL094C 333 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 IAH1YOR126C 717 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 SHE3YBR130C 1278 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YBR219CYBR219C 384 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 TRM13YOL125W 1431 nt4.27□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 HIR2YOR038C 2628 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 AIR2YDL175C 1035 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 BUD26YDR241W 288 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 RNH202YDR279W 1053 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PAD1YDR538W 729 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PAN5YHR063C 1140 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 HYM1YKL189W 1200 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 NEJ1YLR265C 1029 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 CMR3YPR013C 954 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 STR2YJR130C 1920 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 VID30YGL227W 2877 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 CAB3YKL088W 1716 nt4.26□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YMR1YJR110W 2067 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 SAW1YAL027W 786 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 RPF2YKR081C 1035 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ELO3YLR372W 1038 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 RPS10BYMR230W 318 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YNR061CYNR061C 660 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 AIM39YOL053W 1188 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 CUE5YOR042W 1236 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 GMC1YDR506C 1827 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ALG2YGL065C 1512 nt4.25□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 MDM10YAL010C 1482 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PRP9YDL030W 1593 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 TAF5YBR198C 2397 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 SSB2YNL209W 1842 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 MRPS35YGR165W 1038 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PRE7YBL041W 726 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YIM1YMR152W 1098 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PRM7YDL039C 2097 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YMR196WYMR196W 3267 nt4.24□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PRP28YDR243C 1767 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ACT1YFL039C 1128 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ARG3YJL088W 1017 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 AIM23YJL131C 1071 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 UPS2YLR168C 693 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 RUF20RUF20 443 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 VPS21YOR089C 633 nt4.23□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 RKM2YDR198C 1440 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ALD3YMR169C 1521 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 ALD2YMR170C 1521 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 RTC5YOR118W 1704 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 TIF4632YGL049C 2745 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YGR149WYGR149W 1299 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 PUS6YGR169C 1215 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 Q0144Q0144 330 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 CUS2YNL286W 858 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 YOL162WYOL162W 648 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 CKB2YOR039W 777 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 OPY2YPR075C 1083 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 MKS1YNL076W 1755 nt4.22□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 VBA2YBR293W 1425 nt4.21□□□□□ -1.73
SSK1Q07084 HSP82YPL240C 2130 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SHR3YDL212W 633 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 PIB1YDR313C 861 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RIP1YEL024W 648 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 LYS5YGL154C 819 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SSU72YNL222W 621 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 BUD17YNR027W 954 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TMA16YOR252W 537 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 BTS1YPL069C 1008 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 ARC40YBR234C 1155 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 HUL4YJR036C 2679 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 PEP5YMR231W 3090 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 AKL1YBR059C 3327 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MDM38YOL027C 1722 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MGR3YMR115W 1506 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RRB1YMR131C 1536 nt4.21□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YPL260WYPL260W 1656 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TEC1YBR083W 1461 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YDL124WYDL124W 939 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SPR28YDR218C 1272 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 HNT2YDR305C 654 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 FRA2YGL220W 363 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 PEX21YGR239C 867 nt4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms