Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX4Q06945 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX4Q06945 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms