Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDSRQ06136 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms