Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YOR131C	YOR131C	657 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	HSP82	YPL240C	2130 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	YPR015C	YPR015C	744 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	UTP6	YDR449C	1323 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	RAD52	YML032C	1416 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.86	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	YDR444W	YDR444W	2064 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	MDM12	YOL009C	816 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	NAT3	YPR131C	588 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	RKM2	YDR198C	1440 nt		4.85	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	ZRC1	YMR243C	1329 nt		4.84	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	MED2	YDL005C	1296 nt		4.84	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	BUD13	YGL174W	801 nt		4.84	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	EFB1	YAL003W	621 nt		4.84	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.84	□□□□□ -1.63
MRD1	Q06106	SIR1	YKR101W	1965 nt		4.84	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	MSK1	YNL073W	1731 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	GWT1	YJL091C	1473 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	FLC1	YPL221W	2382 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	ORC6	YHR118C	1308 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	TRM11	YOL124C	1302 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RMD1	YDL001W	1293 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	TRM8	YDL201W	861 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YDR249C	YDR249C	1122 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YER085C	YER085C	522 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YGL088W	YGL088W	366 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YKR047W	YKR047W	306 nt		4.83	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	BBC1	YJL020C	3474 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PTC1	YDL006W	846 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	KIN28	YDL108W	921 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YDL228C	YDL228C	642 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	ERG26	YGL001C	1050 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RAD17	YOR368W	1206 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	FES1	YBR101C	873 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PEP5	YMR231W	3090 nt		4.82	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	MET4	YNL103W	2019 nt		4.81	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YDR133C	YDR133C	336 nt		4.81	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	EDC1	YGL222C	528 nt		4.81	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		4.81	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YJR038C	YJR038C	363 nt		4.81	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YMR085W	YMR085W	1299 nt		4.81	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PRM2	YIL037C	1971 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	MET17	YLR303W	1335 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	BCP1	YDR361C	852 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	SUI3	YPL237W	858 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	DSS4	YPR017C	432 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	TDA11	YHR159W	1515 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PHO84	YML123C	1764 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	SPC105	YGL093W	2754 nt		4.8	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	FDC1	YDR539W	1512 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RSC58	YLR033W	1509 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RGP1	YDR137W	1992 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YDR056C	YDR056C	618 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	LNP1	YHR192W	837 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	UTP11	YKL099C	753 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	ADD66	YKL206C	804 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	DSC2	YOL073C	969 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	VPS69	YPR087W	321 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.79	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PAF1	YBR279W	1338 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	MCM21	YDR318W	1107 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	COS4	YFL062W	1140 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	ARC1	YGL105W	1131 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	ARD1	YHR013C	717 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	COS3	YML132W	1140 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YMR114C	YMR114C	1107 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	TPP1	YMR156C	717 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	CUZ1	YNL155W	825 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	SNF8	YPL002C	702 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	COS2	YBR302C	1140 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YCL022C	YCL022C	516 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	PFK1	YGR240C	2964 nt		4.78	□□□□□ -1.64
MRD1	Q06106	YHP1	YDR451C	1062 nt		4.77	□□□□□ -1.65
MRD1	Q06106	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.77	□□□□□ -1.65
MRD1	Q06106	YIL152W	YIL152W	708 nt		4.77	□□□□□ -1.65
MRD1	Q06106	REX3	YLR107W	1215 nt		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms