Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms