Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP1Q04837 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms