Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMX2Q04743 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMX2Q04743 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EMX2Q04743 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX2Q04743 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMX2Q04743 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMX2Q04743 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX2Q04743 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX2Q04743 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EMX2Q04743 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX2Q04743 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms