Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EMX1Q04741 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms