Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATP7AQ04656 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7AQ04656 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms