Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPCQ03188 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPCQ03188 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPCQ03188 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms