Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF8Q02556 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms