Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG1Q02413 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms