Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN2Q02246 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms