Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms