Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms