Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MC1RQ01726 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC1RQ01726 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms