Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms