Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTRA4P83105 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA4P83105 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms