Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX4P78413 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX4P78413 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX4P78413 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX4P78413 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX4P78413 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX4P78413 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX4P78413 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX4P78413 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX4P78413 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX4P78413 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms