Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEP78395 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms