Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT85P78386 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT85P78386 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT85P78386 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT85P78386 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT85P78386 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT85P78386 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT85P78386 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT85P78386 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms