Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC5P78333 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC5P78333 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC5P78333 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC5P78333 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC5P78333 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC5P78333 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC5P78333 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC5P78333 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC5P78333 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC5P78333 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC5P78333 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC5P78333 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC5P78333 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC5P78333 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC5P78333 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC5P78333 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC5P78333 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC5P78333 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC5P78333 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC5P78333 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC5P78333 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms