Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3BP2P78314 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2P78314 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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