Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2IP63279 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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