Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG7P62955 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms