Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSNL1P62760 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSNL1P62760 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSNL1P62760 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms