Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP25P60880 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP25P60880 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms