Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTBP60709 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTBP60709 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTBP60709 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTBP60709 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTBP60709 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTBP60709 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTBP60709 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms