Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC1P59894 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms