Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCBP4P57723 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCBP4P57723 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms