Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RIPK4P57078 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIPK4P57078 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms