Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX10P56693 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX10P56693 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX10P56693 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX10P56693 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX10P56693 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX10P56693 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX10P56693 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX10P56693 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX10P56693 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX10P56693 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX10P56693 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX10P56693 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX10P56693 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX10P56693 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX10P56693 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX10P56693 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX10P56693 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX10P56693 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX10P56693 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX10P56693 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX10P56693 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX10P56693 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX10P56693 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms