Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRPF1P55201 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms