Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA4P54764 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms