Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1B3P54709 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP1B3P54709 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms