Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMTNP53814 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMTNP53814 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMTNP53814 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMTNP53814 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNP53814 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms