Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms