Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIMK2P53671 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIMK2P53671 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms