Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUBP1P53384 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP1P53384 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms