Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX1P52954 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX1P52954 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBX1P52954 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBX1P52954 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBX1P52954 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX1P52954 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX1P52954 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX1P52954 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX1P52954 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX1P52954 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX1P52954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX1P52954 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LBX1P52954 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LBX1P52954 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LBX1P52954 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LBX1P52954 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX1P52954 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX1P52954 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX1P52954 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX1P52954 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LBX1P52954 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms