Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP98P52948 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP98P52948 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP98P52948 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP98P52948 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP98P52948 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP98P52948 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP98P52948 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP98P52948 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP98P52948 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP98P52948 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP98P52948 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP98P52948 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP98P52948 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP98P52948 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP98P52948 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP98P52948 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP98P52948 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP98P52948 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms