Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF143P52747 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms