Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNHP51946 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNHP51946 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNHP51946 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNHP51946 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNHP51946 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNHP51946 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNHP51946 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms